Mistr Yoda je vzezřením malý zelený skřítek neznámého původu. Tento mistr Jedi žil po devět století z nichž osm učil mladé padawany. Jako jeden z mála Jediů pochopil pravou podstatu Síly O Yodovi toho nevíme moc, ale během separatistické blokády Naboo zasedal Yoda v radě Jedi jako velmistr. Když k němu mistr Qui-Gon Jin přivedl mladého Anakina Skywalkera, tak si nebyl jistý, zda je opravdu Vyvoleným. Spolu s ostatními členy rady jej nechtěl přijmout, protože byl moc starý. Po Qui-Gonově smrti to ale nakonec dovolil jeho žáku Obi-Wanovi. Účastnil se jak pohřbu svého přítele, tak i slavnosti osvobození Naboo.
O deset let později, když byla napadena senátorka Amidala, Yoda vyslal její staré přátele Obi-Wana a Anakina, aby ji chránili. Pomohl Obi-Wanovi s vystopováním skryté planety Kamino, kam později zamířil, aby se setkal s klonovači. Když pak byli Jediové v aréně na planetě Geonosis, kde sídlilo vedení Separatistů, téměř poraženi, Yoda dorazil s armádou klonových vojáků, kteří je osvobodili. V bitvě byl jedním z hlavních velitelů a poté bojoval s hrabětem Dooku, svým bývalým učedníkem, který se stal hlavou Separatistů.
Yoda byl během několikaleté války významnou osobou z hlediska jako vojenské taktiky, tak i vítězství rozumu nad hrubou silou. Velká zkouška čekala Yodu ke konci války, kdy jej ze záhrobí kontaktoval jeho starý přítel Qui-Gon. Chtěl po Yodovi, aby odhalil tajemné učení Síly, které on sám nedokončil. Yoda se vydává do soustavy Dagobah, která je velmi spojena se Sílou. Vidí budoucnost řádu Jedi a ví, co se musí stát.
Cesta ho dál dovede k pěti Kněžkám, které jsou přímo spojeny se Sílou. Yoda přijme svojí temnou stránku a odolá všem pokušením, které mu Kněžky nabídnou. Yodova cesta končí na starém domovském světě Sithů jménem Moraband. Čelí zde duchům Sithů i samotnému Darth Baneovi, prastarému sithskému lordovi. Na konci této cesty se Yoda naučil zachovat si svou identitu i po smrti a komunikovat s ostatními duchy.
Na přání kancléře byl Yoda nucen přijmout do rady Jediů Anakina, mistra z něj ale neudělal, což Skywalkera rozhořčilo. Protože na planetě Kashyyyk došlo k velkému konfliktu mezi Wookii a Separatisty, vydává se jim Yoda na pomoc. Když začal rozkaz 66, Yoda se stihl ubránit a za pomoci Žvejkala a Tarffula se dostal ke své lodi. Následně navázal kontakt se senátorem Organou a mistrem Obi-Wanem. Yoda nemohl uvěřit, že zlo začalo vítězit. Spolu s Obi-Wanem pak vyrazil do chrámu Jediů, aby zanechal zprávu pro všechny přeživší Jedie.
Po odeslání zprávy se vydal utkat se se samotným kancléřem Palpatinem, ze kterého se vyklubal sithský lord Darth Sidius. Yoda neuspěl a musel se stáhnout. Během porodu Luka a Leiy, dětí Anakina a Padmé Amidaly, si uvědomil, že vše ještě není ztraceno. Obi-Wana pak naučil tajemnému umění, které se naučil od Kněžek. Zdrcený Yoda se poté usídlil na planetě Dagobah, kde byl daleko od veškerých konfliktů v galaxii.
Za pomocí tajemného učení mohl Yoda komunikovat s ostatními Jedii, kteří se nacházeli na některém z míst spojených se Sílou. V chrámu Jedi na planetě Lothal tak komunikoval s Kananem a jeho učedníkem Ezrou, kteří zde byli podstoupit různé zkoušky.
I po několika letech zůstával Yoda na Dagobahu. Poté co k němu zavítal Luke, kterého za Yodou poslal Obi-Wan, jej začal učit v používání Síly. Yoda Lukovi vykládal o stranách Síly nebo o osudu, který jej možná čeká. Z močálu také vyzvedl Lukovi ponořenou stíhačku, Luke totiž nevěřil, že to dokáže. Varoval ho před nebezpečím, kterým může ohrozit své přátele, Luke mu pouze slíbil, že se vrátí, aby dokončil výcvik.
Jakmile se Luke vrátil na Dagobah, zeptal se Yody, zda je Darth Vader opravdu jeho otec. Yoda přikývl a podivil se, že mu to Vader řekl sám. Následně umírá ve svých 900 letech a stává se duchem. Spolu s Obi-Wanem a Anakinem, který těsně před svou smrtí přešel opět na světlou stranu Síly, pak zavítá na oslavu vítězství nad císařem.