
Ο Νταρθ Κέιντους στο πόλεμο.
- «Είναι ανόητο το να παρομοιάσουμε τη Γαλαξιακή Συμμαχία με την Αυτοκρατορία και το Κορέλια ως την Επαναστατική Συμμαχία. Επειδή αυτό είναι που θα μπορούσε να συμβεί, μια επανάσταση-μια ανόητη και αχρείαστη.»
- — Λουκ Σκαϊγουόκερ, 40 ΜΜΓ
Ο Δεύτερος Γαλαξιακός Εμφύλιος Πόλεμος, εναλλακτικά γνωστός ως ο Πόλεμος Συμπολιτείας-Γαλαξιακής Συμμαχίας, Νέος Γαλαξιακός Εμφύλιος Πόλεμος, και η δεύτερη Εξέγερση του Κορέλια, που διήρκεσε απο το 40 ΜΜΓ μέχρι το 41 ΜΜΓ ήταν μια σύγκρουση μεταξύ των Πέντε Κόσμων-η οποία αργότερα μετατράπηκε σε μια διαστρική συμμαχία γνωστή ως η Συμπολιτεία-και της Γαλαξιακής Ομοσπονδίας των Ελεύθερων Συμμαχιών. Η σύγκρουση ξεκίνησε το σύστημα Κορέλια αποσυνδέθηκε απο τη Συμμαχία λόγω τοπικών περιορισμών άμυνας και αυξημένων φόρων για την ανασυγκρότηση μετά το Πόλεμο Γιούζαν Βονγκ, και συμμάχησε με τους Μποθαούι, Μπέσπιν και Φόντορ, σχηματίζοντας τη Συμπολιτεία. Καθώς η σύγκρουση κλιμακώθηκε γρήγορα, το Νέο Τάγμα των Τζεντάι πολέμησε στο πλευρό της Συμμαχίας ενάντια στους επαναστάτες. Πολλοί που ήταν σύμμαχοι στο Πρώτο Γαλαξιακό Εμφύλιο Πόλεμο και στο Πόλεμο Γιούζαν Βονγκ βρέθηκαν σε αντίπαλα στρατόπεδα κατά τη διάρκεια αυτής της σύγκρουσης.
Τελικά, πολλά γεγονότα στο πόλεμο έγιναν ανεξέλεγκτα, με μια αποφασιστική νίκη του στόλου να αποδεικνύεται αδύνατη. Μέσα σε μήνες σφοδρών ναυμαχιών, η Φρουρά της Γαλαξιακής Συμμαχίας σχηματίστηκε στο όνομα της κρατικής ασφάλειας, και υπό την ηγεσία του Τζέισεν Σόλο, διέπραξαν ενέργειες όπως η εκδίκηση και η δολοφονία διαφωνούντων που θεωρούνταν όλο και περισσότερο δικτατορικά. Κάνοντας ένα πραξικόπημα η Ναύαρχος Τσα Νάιθαλ και ο Σμήναρχος Τζέισεν Σόλο απομάκρυναν τον Αρχηγό του Κράτους, Καλ Όμας, και πήραν τη θέση του στο Κόρισαντ. Αφού διαφθάρθηκε απο τη Κυρία των Σιθ, Λουμίγια, και έγινε μαθητευόμενος της, ο Τζέισεν μυστικά έγινε ο Νταρθ Κέιντους, ο νέος Σκοτεινός Άρχοντας των Σιθ αφού σκότωσε τη Μάρα Τζέιντ Σκαϊγουόκερ.