Il 212° Battaglione operò per la prima volta su Christophsis sotto i Generali Kenobi e Skywalker: durante la battaglia operò in correlazione con la Compagnia Torrent, aiutando a respingere l'iniziale attacco dei droidi e contrattaccando fino a reprimerli.
Su Teth il 212° arrivò in soccorso della Torrent e si occupò di eliminare le rimanenti forze droidi comandate da Ventress, liberando così il monastero.
Nella Battaglia di Ryloth la Compagnia Fantasma si occupò prima di attaccare la città di Nabat in modo da distruggere la contraerea separatista, quindi partecipò all'assalto alla capitale Lessu.
Il 212° partecipò anche alla Seconda Battaglia di Geonosis; le truppe di Cody e Kenobi formavano una delle punte del tridente durante l'atterraggio al "Point Rain" e furono le uniche a raggiungerlo subito. Una volta a destinazione, le truppe organizzarono un perimetro difensivo con AT-TE e LAAT/i atterrati, resistendo all'assalto dei Geonosiani e dei droidi fino all'arrivo del supporto aereo. Si unirono poi alla 501esima e alle forze del Generale Mundi.
Nella Battaglia di Utapau il Generale Kenobi portò con sé due battaglioni, tra cui il 212°. Questo ingaggiò le forze di Grievous al decimo livello di Pau City subendo gravi perdite a causa della superiorità numerica dei nemici.
Quando fu dato l'Ordine 66 il 212° era ancora su Utapau, dove un AT-TE sparò al Generale Kenobi senza però riuscire ad ucciderlo. I cloni si occuparono poi di sconfiggere le rimanenti forze separatiste e soggiogarono il pianeta.