艦隊司令部(Fleet Command)は反乱同盟の宇宙軍を指揮する司令部門である。1 BBYに行われたフラクチャー作戦当時、艦隊司令部のアンジ・ザヴォア大佐がラダス提督の連絡要員としてヤヴィン4のベース・ワンに配属されていた。