5000 BBY, 초공간 대전쟁의 여파 이후 시스 제국의 잔당 세력은 미확인 지역의 정착해 제국을 설립하였다. 시스의 암흑 군주인 나가 사도우의 의해서 벌어진 은하 공화국과 제다이 기사단에 관해 전쟁 후에 우주로 탈출하였고 시스 군주 비셰이트와 제국의 잔당 세력들은 새로운 고향을 찾아 우주를 정처없이 돌아 다녔다. 이십 년 이후 제국의 영토 였던 곳으로 부터 떠나게 되었고 잔당 세력들은 잊혀진 행성인 드로문드 카스를 발견하게 된다. 행성에 정착을 하여 시스 제국의 재건 과정을 시작하게 된다.
재건 과정에서 비셰이트는 정돈된 사람들 앞에서 자신이 시스의 암흑 군주 이자 황제로 되는 것으로 선포 하였다. 황제는 시스의 군주들과 함께 어둠의 평의회를 관리를 하고 카스 시티의 수도를 설립하고 강력한 전쟁 기계를 구축하기 시작하였다. 은하 공화국과 다시 한 번 전투을 위해 목적에서 제국은 점차 확대하고 더 많은 힘과 영향력을 확보, 일 만 년 동안 그 목표를 향해 일해왔다. 그 시간 동안 제국은 제다이 기사 레반과 말락에 의해서 발견 되었다. 레반과 말락은 황제와 시스들에 의해 강제적으로 포스의 어두운 면으로 돌아서게 되었고 시스가 되었다. 그들은 결과적으로 제국의 침략에 대한 선봉 역할를 위해 송환 되었지만 훈련성이 없는 그들은 탈주하여 자신들의 시스 제국을 형성하지만 그들의 제국과 잔당들은 공화국에게 패배 당하고 제국의 지식은 숨겨져 있었다.
약 삼 백년 후 시스 제국은 여전히 황제 비셰이트의 지배 아래에서 있었고 은하계에서 중대하게 돌아올 준비를 하고 있었다. 이후 명백하게 공화국의 영토을 건너 외곽 은하 지역에서 꼭두각시 정부를 설치 하였고 시스는 비교 할 수 없는 비율로 공화국 지역을 침략하여 맹공격을 하였다. 외곽 은하 지역을 포착하여 많이 확보 하였으며 서서히 은하 대전쟁의 초기로 들어섰다. 시스 황제는 공화국을 누르기 위한 준비을 시작 하였다. 은하핵을 공화국에 대한 공격 발기점의 핵심으로 하였고 그 전쟁에 여러 가지 난관에도 불구하고 만달로리안 군사 집단과 동맹를 통해 공화국의 경제에 타격 주었고 한 번 더 앞으로 급증하였다. 그러나 봉쇄는 결국 할일로 비스츠에 의해 부서져버렸다. 또 다른 교착 상태로 전쟁을 가져온 공화국의 보강이 되었다. 전쟁으로 거의 3년 후 제국은 은하계을 놀라게 하였으며 길어진 전쟁에서 뜻밖의 일로 어둠의 평의회는 공화국에게 평화의 제안을 하였고 절망적인 공화국에서 의회는 받아들었다. 그러나 얼데란의 평화 회담 당시 제국은 공화국의 수도인 코러산트를 몰래 공격을 개시. 이 공격이 제국의 활발한 성공이었고 시스는 공화국을 강제로 그들의 문서 초안에 서명을 하게 하였으며 코러산트의 조약으로 은하 대전쟁이 종전 되었다.
전쟁의 끝과 함께 끝에서 제국은 어느 때 보다 강해졌으며 시스 황제는 대중들이 전망하는 앞에서 물러났으며 어둠의 평의회에게 제국의 일상적인 유지 보수의 책임을 전달하였다. 제국의 공존 결과로 인해 행성 간에 냉전 (Cold War) 이 발생하였으며 대전쟁 직후에 발생하였다. 대리전 당시 대리권에서 교전중 제국은 공화국과 그 동맹국들에 의해 작은 충돌이 벌어졌으며 전쟁은 다시 시작했다. 제국은 리더십의 일원을 잃고 치명적인 패배를 겪는 일이 시작 되었으며 내분과 권력에 미친 시스 군주들 간의 내부 투쟁에서 곧바로 취약해져 버렸다. 제국의 내분은 다스 마르의 전환점 이었다. 그는 미래를 확보하여 제국을 안정화 할 수 있다면서 공화국과 동맹을 조직하는 사건이 발생하였으며 이러한 행위는 레반과 비셰이트에게 위협이 되었다. 황제의 분노는 제국을 유지 하는 임무와 전투에서 제국의 군대를 주도하는 다스 맬거스, 드레드 마스터, 다스 마르에게서 나오게 되었다.
3636 BBY 영원한 제국은 은하계의 나머지 부분을 침공 시스와 공화국을 모두 물리치고 정치, 군사를 설립하였고 이 두 가지 상태에 걸쳐 경제 주도권을 잡게 되었다. 분쟁이 발생했을 당시 다스 아씨나 한 명을 제외하고 어둠의 평의회에 나머지 일원들 중 많은 사람들이 사망하거나 신비한 상황에서 사라져갔다. 갑작스런 그녀의 라이벌의 실종과 시스 황제의 분노 말할 것도 없었고 제국의 불명예가 되었다. 그녀에게 왕관이 주어졌으며 시스의 황후가 되었다.
새로운 외부 위협에도 불구하고, 양측은 공식적으로 적대 행위를 종료하거나 협력의 모든 종류의 논의하기 것을 거부했다. 다스 마르에 의해 구축된 이전 협력은 십 년간의 과정을 통해 지속적인 유산을 가질 것이라고 생각되었다. 결과적으로 공통의 적을 상대로 이탈하는 발판을 마련했으며 제국의 회원이 자진해서 비공식 동맹과 함께 공화국으로 이탈하였다.
2000 BBY 쯤 제국은 드러나지 않게 은하계에서 사라졌다. 공화국은 다시 한 번 유일하게 주도권을 가진 은하계 정부가 되었다.