시스 홀로크론은 시스가 사용하는 홀로크론으로, 그들에 대한 정보가 들어 있었다. 제다이 홀로크론과 기능이 유사하고, 일반적으로 피라미드와 같은 사면체였으나, 반면에 제다이 홀로크론은 직육면체의 형태를 띄었다. 포스의 어두운 면에 접근하려는 사람들에게만 제어가 되었고 제다이 기사단에서는 이러한 인공 유물을 은하계에서 가장 위험한 것으로 진지하게 생각하였다. 반란군이 은하제국에 대항하여 싸우는 동안 에즈라 브리저는 말라코어행성에 있는 말라코어 시스 사원 내부에서 시스 홀로크론을 찾아냈다.