- "Nosso problema é simples – a Marinha Separatista tem quatro vezes o número de naves que nós temos. Devemos diminuir sua produção naval ou esta guerra vai acabar rapidamente, e não a nosso favor."
- ―Mace Windu
A Marinha Separatista, era uma imensa coleção de naves de guerra e naves espaciais providenciadas pelas forças armadas dos membros contribuintes da Confederação de Sistemas Independentes.
História[]

A Malevolência serviu como nave almirante para o General Grievous, destruindo muitas naves de guerra da República.
A Marinha foi organizada em torno de flotilhas de destróiers e fragatas construídas por centenas de sistemas estelares agressivamente independentes, que as doaram para as diversas organizações comerciais que lideravam a guerra. As principais naves de guerra foram cedidas pela Federação de Comércio.
Embora as naves tenham sido muitas vezes comandadas por oficiais droides, muitas frotas e bloqueios foram colocados sob o comando de capitães e almirantes orgânicos. Um oficial notável era um Harch com o nome de Trench, um almirante temido cujas táticas dizimaram várias frotas da República. Trench pereceu durante a Batalha de Christophsis no segundo ano das Guerras Clônicas.
No começo da guerra, a pesada nave de batalha Malevolência usou o seu mortal Canhão de íons de grande efeito, aterrorizando assim as linhas de abastecimento da República, e encurtando o trabalho de várias forças-tarefas navais como a frota de Plo Koon, enquanto ela estava estacionada no Sistema Abregado. A nave foi destruída por um grupo de ataque Jedi, que reprogramou a nave para colidir com a Lua Morta de Antar.
A marinha dependia de grandes estaleiros administrados por Supervisores que comandavam os escravos de que os Separatistas dependiam para construir suas imensas naves de guerra rapidamente. Eles fizeram o uso de trabalhadores orgânicos em vez de droides, para que a República não bombardeasse seus estaleiros sem imensas perdas civis. Em um esforço para parar a produção, uma equipe formada por Anakin Skywalker, Obi-Wan Kenobi e Ahsoka Tano se infiltrou nos Estaleiros Gwori, administrados por Juhm, e libertaram os escravos da instalação, permitindo uma equipe de ataque bombardear o local. A destruição do estaleiro fez pender a balança da guerra para o lado dos Separatistas, permitindo que as Guerras Clônicas, prosseguissem.
Uma das naves-almirante do General Grievous, a Mão Invisível liderou a Marinha numa campanha de atirar e destruir, que interrompeu viagem, comunicação e comércio nas regiões da Orla Exterior, e permitiu invasões em massa aos planetas vulneráveis dessa mesma região.

Naves de guerra separatistas batalham sobre Coruscant
Mais para o fim da guerra, milhões de naves de guerra Separatistas lutaram contra a República em várias campanhas dos Cercos à Orla Exterior, enquanto uma força-tarefa de várias outras milhares usaram uma rota secreta para chegar à Coruscant em uma tentativa de capturar o Supremo Chanceler Palpatine. Esta força-tarefa foi derrotada na Segunda Batalha de Coruscant (Guerras Clônicas) e seus remanescentes recuaram.
Resultado[]
No entanto, a Confederação ainda tinha muito mais frotas de naves em suas bases nos Territórios da Orla Exterior, mas estas foram esquecidas após a desativação dos exércitos droides.
Anos mais tarde, algumas naves restantes apareceram na Marinha Remanescente de Gizor Dellso, uma frota estelar que Gizor Dellso criou à partir dos Redutos Separatistas. Esta frota foi destruída na conquista de Mustafar pela Legião 501.
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Uma Nave de controle droide classe-Lucrehulk
Estações Espaciais[]
- Estação Espacial de Tesouros do Clã Bancário
- Nave núcleo classe-Lucrehulk
- Esfera de Batalha
- Plataforma de Armas do Clã Bancário InterGaláctico
- Estação de Desenvolvimento de Droides-Abutre Automatizados
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- Nave de Batalha Starcrusher
- Couraçado atmosférico classe-Conqueror
- Couraçado Geonosiano
- Nave de batalha classe-Lucrehulk
- Nave de controle droide classe-Lucrehulk
- Cruzador pesado classe-Subjugator
Cruzadores de Batalha[]
- Marca Baluarte I
- Marca Baluarte II

A nave-almirante Separatista Mão Invisível
Cruzadores e Destróiers[]
- Cruzador Shadowblade
- Cruzador classe-Diamond
- Fantail
- Nave núcleo classe-Lucrehulk
- Esfera de Batalha
- Cruzador classe-Lucrehulk
- Destróier classe-Lucrehulk
- Destróier/cargueiro classe-Providence
- Destróier Ligeiro classe-Recusant
- Destróier Sabaoth
- Cruzador Separatista
- Destróier Estelar Separatista
- Destróier da Frota Tempestade
Fragatas[]

Um Cruzador Separatista
- Fragata Estelar Classe Munifcent
- Fragata Sabaoth
- Nave de bombardeio Separatista
- Fragata de Mísseis da Federação do Comércio
- Nave de suporte Umbaran
- Fragata classe-Wavecrest
Corvetas[]
- Corveta da Associação Comercial
- Corveta CR90
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- Fragata armada classe-Corona (O design foi ignorado pela CSI, devido a não operar como uma nave droide, então o projeto foi interrompido pouco depois)
Caças estelares[]
- Caça anfíbio
- Caça estelar Belbullab-22
- Caça perseguidor C-73
- Caça estelar Avançado da CSI

Droide Abutre
- Tri-droide
- Caça estelar classe-Ginivex
- Implementador Hex
- Interceptador ligeiro Mankvim-814
- Caça de defesa territorial classe Nantex
- Caça de Superioridade Espacial NovaSword
- Caça estelar Porax-38
- Caça estelar classe-Vampiro
- Defensor Sabaoth
- Caça estelar Sabaoth
- Caça estelar droide classe-Scarab
- Droide Spearhead
- Droide de Batalha Autopropulsionado de Geometria Variável, Mark I
- Headhunter Z-95

Visão de perfil de uma classe Nantex
Bombardeiros[]
- Bombardeiro de Ataque Belbullab-24
- Bombardeiro classe-Hyena
- Bombardeiro droide da Federação do Comércio
Transportes[]
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A Nave de Desembarque CC-9979
- Nave de desembarque C-9979
- Veículo Cargueiro Armado
- Transporte Besouro XT
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- Nave de Embarque classe-Droch
- Nave de Descida Trandoshana
Lançadeiras[]

- Transporte de Luxo BC-714
- Fantail
- Transporte Interestelar classe-Hardcell
- Corveta Interestelar classe-Punworcca 116
- Nave de transporte classe Sheathipede
- Lançadeira Tri-asas
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- Nave de containers classe-Lucrehulk
- Nave de suprimentos Separatista
Petroleiros[]
- Petroleiro classe-Lucrehulk
- Nave de abastecimento Separatista
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- Aurora
- Colicoid Swarm
- Corpulentus
- Devastation
- Discord
- Commerce Force
- Gahenna
- Invicible
- Mão Invisível
- Lapiz Cutter
- Last Call
- Lucid Voice
- Malevolência
- Malevolência II
- Mersel Kebir
- Patriot Fist
- Prosperous
- Reaper
- Reaver
- Shark
- Skorp-Ion
- Soulless One
- Starcrusher
- Starshot
- Tide of Progress XI
- Trident
- Unlimited Projection
- Voice of Industry
Unidades Conhecidas[]
- Frota Bulwark
- Bloqueio de Christophisis
- Primeira Frota Separatista
- Terceira Frota Separatista
- Frota D-1600
- Ala de Caças Zero-Zero
- Grupo Um
- Frota de Defesa do Mundo Natal de Rendili
- Bloqueio de Ryloth
- Esquadrão Sabaoth
- Frota Tempestade
Tropas[]
- Oficiais da CSI
- Droides de Batalha série-B
- Droide de Batalha B-1
- Fuzileiros Droides
- Droides Bombeiro
- Droides de Batalha Foguete
- Super Droides de Batalha B2
- Droides de Batalha B2-RP
- Super Droides de Batalha série B2HA
- Droides de Comando série BX
- Droidekas
- IG-100 MagnaGuardas
- Droides de Batalha série OOM
- Droides de batalha piloto série OOM
- Droides de batalha piloto OOM
- Droides de sabotagem Pistoeka
- Droides táticos série T
Aparições[]
- Star Wars: The Rise and Fall of Darth Vader
- LEGO Star Wars: The Video Game (aparição não canônica)
- LEGO Star Wars: The Complete Saga (aparição não canônica)
- Star Wars: Republic Commando
Lahara Patrol Attacked, Jedi to Send Aid—HoloNet News Vol. 531 56
- Star Wars Episódio II: O Ataque dos Clones (primeira aparição)
- Star Wars: Battlefront II
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 7"
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 10"
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 11"
- Star Wars: Clone Wars PhotoComic
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 20"
Star Wars: The Clone Wars – "Cat and Mouse"
- Star Wars: The Clone Wars (romance)
Star Wars: The Clone Wars – "Supply Lines"
- The Clone Wars: Shakedown
Star Wars: The Clone Wars – "Rising Malevolence"
Star Wars: The Clone Wars – "Shadow of Malevolence"
Star Wars: The Clone Wars – "Destroy Malevolence"
Star Wars: The Clone Wars – "Clone Cadets" (Aparição em Newsreel)
Star Wars: The Clone Wars – "ARC Troopers"
Star Wars: The Clone Wars – "Downfall of a Droid"
Star Wars: The Clone Wars – "Duel of the Droids"
Star Wars: The Clone Wars – "Sphere of Influence" (aparece em flashback(s))
- Star Wars: The Clone Wars: Jedi Alliance
- LEGO Star Wars: The Quest for R2-D2 (jogo) (aparição não canônica)
- LEGO Star Wars: The Quest for R2-D2 (filme) (aparição não canônica)
- Star Wars: The Clone Wars: Republic Heroes
- The Clone Wars: Act on Instint
- The Clone Wars: Hunting the Hunters (Parte I)
Star Wars: The Clone Wars – "Duchess of Mandalore"
Star Wars: The Clone Wars – "Heroes on Both Sides"
Star Wars: The Clone Wars – "Nightsisters"
Star Wars: The Clone Wars – "The Citadel"
Star Wars: The Clone Wars – "Citadel Rescue"
Star Wars: The Clone Wars – "Plan of Dissent"
Star Wars: The Clone Wars – "Bound for Rescue"
- Star Wars: Galactic Battlegrounds: Clone Campaigns
- Star Wars Battlefront: Elite Squadron
- Labyrinth of Evil
- Star Wars: Obsessão
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 22"
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 23"
Star Wars: Guerras Clônicas – "Capítulo 25"
- Reversal of Fortune (aparece em holograma)
- Star Wars Episódio III: A Vingança dos Sith (quadrinhos)
- Star Wars Episódio III: A Vingança dos Sith
- Star Wars Episódio III: A Vingança dos Sith (romantização júnior)
- Star Wars: Dark Times: Paralells
- Dark Lord: The Rise of Darth Vader
- Star Wars Rebellion: My Brother, My Enemy
- Star Wars Battlefront: Renegade Squadron (aparição não canônica)
Fontes[]
- Attack of the Clones: Incredible Cross-Sections
- Revenge of the Sith: Incredible Cross-Sections
- The New Essential Chronology
- The New Essential Guide to Vehicles and Vessels
- Star Wars: The Clone Wars: The Visual Guide
TCW Episode Guide: Rising Malevolence em StarWars.com (conteúdo agora obsoleto; link de backup não verificado!)
TCW Episode Guide: Duel of the Droids em StarWars.com (conteúdo agora obsoleto; link de backup não verificado!)