Не знаю насчёт КНС, но до выхода Эпизода II некоторые считали, что Палпатин рассматривал Торговую Федерацию как прикрытие для своего влияния. Лишь провал на Набу убедил его, что будущую Империю нужно строить не за счёт дроидов...
Уже потом стало известно, что цель иная: смена канцлера Республики. В годы выхода Эпизодов I-II не было сомнений, что и Дарт Мол должен был сыграть свою роль как полноценный ученик Сидиуса. То есть если бы забрак выжил на Набу, то созданная впоследствии Империя Палпатина тоже была бы иной, не как при Вейдере.
Опять же, я исхожу из того, что сам Мол едва ли смог бы стать лидером КНС как Дуку. У графа явная харизма, связи, влияние. Он действует в открытую, раздразнивая Джедаев и руководство Республики. Мол же – тень, действует неожиданно, исподтишка. Было мнение, что Сидиус вообще был готов рассматривать оба варианта – если даже победит КНС и Корусант капитулирует, он же всё равно останется у власти.